明清时期的科举考试中的"别称"主要是指除了正式名称之外的其他称呼。科举考试是古代中国选拔官员的一种制度，明清两代的科举考试主要包括乡试、会试和殿试三个阶段。

1. **乡试**：通常在省城举行，考中的称为“举人”，第一名被称为“解元”。乡试的别称有时也被称为“秋闱”，因为考试一般在秋季进行。

2. **会试**：由礼部主持，在京师的贡院举行，考中的称为“贡士”，第一名被称为“会元”。会试的别称有时也被称为“春闱”，因为考试一般在春季进行。

3. **殿试**：由皇帝亲自主持，地点在紫禁城的太和殿（或其它指定场所），考中的称为“进士”，前三名分别被称为状元、榜眼和探花。殿试没有特别的别称，但因其重要性，有时也被视为科举的最高峰。

总的来说，明清科举考试的主要别称就是“秋闱”和“春闱”，用以区分不同季节举行的考试。