主管全国保密工作的机构是中华人民共和国国家保密局。国家保密局是中国政府负责保密工作的职能部门，主要职责包括：制定保密工作的方针政策、法律法规；指导和监督机关、单位的保密工作；开展保密宣传教育；进行保密技术防护和检查等。保密工作对于维护国家安全和社会稳定具有重要意义。如果您有其他问题或需要更多帮助，请随时告诉我。