种子主要是由植物的雌蕊中的胚珠发育而来的。在植物完成授粉后，花粉粒在胚珠所在的子房内萌发形成花粉管，并释放出精子。其中一个精子与卵细胞融合形成合子（即未来的胚胎），另一个精子则与两个极核融合形成初生胚乳核（即未来的胚乳）。随后，胚珠逐渐发展成为种子，其中包含了新的植物胚胎和/或胚乳。

整个过程大致如下：
1. **胚珠**：原始的结构，在受精后会发育成种子。
2. **胚胎**：由精子与卵细胞融合形成的合子发育而来，是新植物的基础。
3. **胚乳**（在某些植物中）：由一个精子与两个极核融合形成，为胚胎提供营养。

简而言之，种子主要由胚珠发育而来，其中包含有未来的植物胚胎及其所需的营养物质。