封闭式框架协议采购中，采购人确定第二阶段成交供应商的方式通常包括以下几种：

1. 直接选定：根据第一阶段的评审结果，采购人可以直接从已经入围的供应商名单中选择合适的供应商作为第二阶段的成交供应商。

2. 二次竞价：在第一阶段确定了入围供应商之后，采购人可以要求这些供应商进行二次竞价或谈判，最终确定成交供应商。

3. 随机抽取：对于某些特定情况，采购人可能会采用随机抽取的方式来决定第二阶段的成交供应商。这种方式通常用于确保过程的公平性和透明度。

4. 综合评审：结合供应商的技术能力、价格、服务承诺等多个因素进行综合评审，最终确定成交供应商。这种方式更侧重于全面评估供应商的能力和条件。

具体采用哪种方式，取决于具体的采购规定、项目特点以及采购人的实际需求。在实际操作过程中，还需要遵循相关法律法规的要求，确保采购过程的合法性和合规性。