D、以上全是

海水的颜色确实受到多种因素的影响，而不仅仅是因为太阳光的散射导致的蓝色。虽然太阳光是影响海水颜色的一个重要因素（特别是蓝光被散射得更多，使得海水通常看起来是蓝色的），但还有其他因素也会显著改变海水的颜色：

B、海水中的物质及深度：海洋中的浮游植物（如藻类）、悬浮的沉积物、溶解的有机物等都会改变水体的颜色。例如，富含浮游植物的水域可能会呈现绿色或棕色；深水区由于光线难以穿透，看起来可能更暗，甚至接近黑色。

A、太阳光：太阳光的强度和角度会影响我们看到的海水颜色。在不同的时间和天气条件下，太阳光照射到海面的方式不同，这会导致海水颜色的变化。

C、云层：云层可以反射和散射太阳光，从而影响到达海面的光线类型和强度，进而影响海水的颜色感知。

因此，正确答案是 D、以上全是。