霉菌的主要生殖方式是孢子生殖。霉菌会产生大量的孢子，这些孢子可以随风传播，找到适宜的环境后就会萌发生长为新的霉菌个体。此外，霉菌也可以通过菌丝体的分裂进行无性繁殖。但在自然条件下，以产生孢子的方式进行繁殖是最主要的生殖方式。